قاسم جعفری، سخنگوی کمیسیون آموزش و تحقیقات مجلس شورای اسلامی در گفتگو با خبرنگار نماینده درباره تفاوت این گزینه با وزیرعلوم قیلی اظهار داشت: آرزو می کردیم فرجی دانا به خواسته های قانونی نمایندگان تمکین می کرد تا این تغییر و تحول در این وزارت خانه به این مهمی رخ نمی داد.

وی ادامه داد: دیروز که وزیر علوم برای بحث و گفتگو به کمیسیون آموزش آمدند خیلی نتوانستند اقناع کننده صحبت کنند.

سخنگوی کمیسیون آموزش و تحقیقات عنوان داشت: آقای نیلی برای رای اعتماد گرفتن از مجلس راه دشواری را در پیش دارند و به دلایل مختلفی ایشان نتوانستند نظر اعضای کمسیون را به برنامه ها و راهبردهایشان جلب کنند.

نماینده مردم بجنورد در مجلس شورای اسلامی خاطرنشان کرد: سوالات مختلفی در روز گذشته از وزیر پیشنهادی علوم ازمحورهای فنی گرفته تا اشراف به کار و برنامه هایی که برای رشد فرهنگ علمی در کشور دارند، چگونگی پیگیری منویات رهبری و حرکت برمبنای نقشه جامع علمی  تا سوابق علمی و اجرایی ایشان وسوالات زیادی پرسیده شد و نمایندگان تا حدزیادی از پاسخ ها قانع نشدند.